שמן בנזואין הוא שמן אתרי בעל יתרונות רבים, אך ישנם גם סיכונים שיש לקחת בחשבון:

1. רגישות עורית: כמו כל שמן אתרי, יש לבדוק את השמן על שטח קטן של העור לפני השימוש הרחב, כדי לוודא שאין תגובה אלרגית.
2. שימוש פנימי: שמן בנזואין מיועד לשימוש חיצוני בלבד ואין לצרוך אותו פנימית.
3. בעיות נשימה: במקרים נדירים, השמן עלול לגרום לתחושת מחנק או קושי בנשימה, במיוחד אם משתמשים בו בכמויות גדולות או במרחבים סגורים.
4. הריון והנקה: יש להימנע משימוש בשמן בנזואין במהלך ההריון וההנקה, שכן השפעותיו על נשים בהריון אינן ידועות במלואן.